このスクリプトで使用するテーブルは以下の４つです。

グループ＝大カテゴリ、エントリ＝中カテゴリ、エントリタイプ＝小カテゴリ。
不要なカラムは省略しています。

pict_group

gid	gp_dir	gp_sortkey	gp_name
1	button	2	ボタン
2	background	1	背景画像
3	icon	3	アイコン

pict_entry

eid	gid	entry_dir	entry_name	entry_entrydate
1	1	004	ドット#01	2000-09-13 00:00:00
2	1	008	バーコード#01	2000-09-13 00:00:00
3	2	008	花#01	2000-10-20 00:00:00
4	3	001	矢印	2000-09-13 00:00:00

pict_entry_type

tid	eid	type_dir	type_name	type_width	type_height
1	1	a	あお	61	31
2	1	b	あお	61	31
3	2	a	みどり	55	55
4	2	b	あお	55	55

pict_log

log_no	tid	log_date
1	2	2007-03-12 01:00:59

グループの削除時のトリガー

CREATE TRIGGER remove_group
AFTER
  DELETE ON pict_group
BEGIN
  DELETE FROM pict_entry WHERE pict_entry.gid = old.gid;
END;

グループが削除された時、そのグループに属するエントリを削除するトリガー。

SQLiteは「FOR EACH ROW」しかサポートされていませんので、書かなくても複数の行が実行された場合（グループの一括削除等）では自動的に「FOR EACH ROW」として行分実行されます。

同じように、エントリが削除されたらエントリタイプが削除されるトリガー、エントリタイプが削除されたらログが削除されるトリガーを作っておけば、グループを1つ削除するとそれに後方リンクしているデータも勝手に削除されるようになります。（※ログを削除したらグループが削除されるわけではありません）

エントリ追加時のチェックトリガー

CREATE TRIGGER if_entry_validate
BEFORE
  INSERT ON pict_entry
BEGIN
  SELECT CASE
    -- グループの整合性をチェック
    WHEN ((SELECT gid FROM pict_group WHERE pict_group.gid = new.gid) IS NULL)
    THEN RAISE(ABORT, 'group is undefined')
    -- エントリの重複をチェック
    WHEN ((SELECT entry_dir FROM pict_entry WHERE pict_entry.gid = new.gid AND pict_entry.entry_dir = new.entry_dir) IS NOT NULL)
    THEN RAISE(ABORT, 'entry exists')
  END;
END;

エントリを追加した際に、

• グループが存在するか
• ディレクトリが既に登録されていないか

をチェックするトリガー。
マッチするとクエリエラーになります。

ABORTよりもFAILの方がいいのかな？

MySQLで本気だす。